Πρωτογεωμετρική-Γεωμετρική περίοδος (970-700 π.Χ.)

Μετά την παρακμή του ανακτόρου της Κνωσού και τη συρρίκνωση του εμπορίου ο ρόλος της Αμνισού μάλλον υποβαθμίστηκε, γι᾽αυτό και τελικά το “χαλεπό” κατά τον Όμηρο λιμάνι εγκαταλείφθηκε. Την ίδια εποχή, η μινωική εγκατάσταση στον Πόρο-Κατσαμπά εγκαταλείφθηκε επίσης. Η πόλη της Κνωσού ωστόσο συνέχισε να ευημερεί τους επόμενους αιώνες. Τα εντυπωσιακά ευρήματα των ανασκαφών στο Βόρειο Νεκροταφείο τεκμηριώνουν τη συνέχιση των εμπορικών και καλλιτεχνικών ανταλλαγών της Κνωσού με κέντρα έξω από το νησί, διαμέσου του επινείου της, που πρέπει πλέον να ήταν μόνο το λιμάνι του Ηρακλείου. Η πρωτογεωμετρική κεραμική που ήρθε στο φως κατά τις ανασκαφές των George Miles και Μανόλη Μπορμπουδάκη στο προαύλιο του ναού του Αγίου Πέτρου των Δομινικανών, στο παραθαλάσσιο μέτωπο, φαίνεται να επιβεβαιώνει τη συνέχιση της δραστηριότητας γύρω από το λιμάνι του Ηρακλείου στην αυγή της εποχής του Σιδήρου.